Dolžina genskega urejanja s tradicionalno tehnologijo je večinoma manjša od 5 kb in daljši kot je urejeni fragment, nižja je uspešnost.Poleg tega je treba za izdelavo modela miši z dolgimi fragmenti knock-in/knock-out z uporabo tradicionalnih tehnik vzrejati in pregledovati himerne miši 2-3 generacije, da dobimo ciljne miši, celoten postopek pa traja več kot 10- 12 mesecev.
Prednosti urejanja genov z dolgimi fragmenti so v njegovi zmožnosti premagovanja nekaterih omejitev tradicionalnih metod urejanja genov.